En 1936, Dom Alexis Presse, moine cistercien banni de son ordre, arrive seul dans les ruines du monastère de Boquen, en Bretagne. Il entreprend de refonder là une communauté suivant la Règle de St Benoît, et de reconstruire le bâtiment. Vivant dans une grande précarité, la communauté ne sera jamais très nombreuse, mais Boquen aura un certain rayonnement. 
En 1965, la reconstruction achevée, Dom Alexis meurt. Un travail d'enquête auprès des anciens compagnons de Dom Alexis a fourni le matériau documentaire du film. Les témoignages de huit d'entre eux sont réinterprétés par des acteurs dans le décor même de l'histoire, l'abbaye de Boquen et ses alentours. 
Ils se complètent, se répondent et s'imbriquent. L'esprit du moine disparu est toujours là, présence invisible, et c'est comme s'il assistait au récit de sa propre histoire.